Sydän-Suomen jätelautakunnan yhteistoiminnan järjestämisestä ja hallinnosta vastaa Saarijärven kaupunki. Jätelautakunnassa on yhteensä 13 jäsentä. Lautakunnan alaisina viranhaltijoina toimivat jätehuoltoasiamies ja jätehuoltosuunnittelija.

Sopijakuntien valtuustot nimeävät lautakuntaan jäseniä ja henkilökohtaisia varajäseniä seuraavasti; Äänekosken kaupunki 2,  Hankasalmen, Kannonkosken, Karstulan, Kinnulan, Kivijärven, Multian, Petäjäveden, Pihtiputaan ja Uuraisen kunnat sekä  Saarijärven ja  Viitasaaren kaupungit kukin yhden jäsenen.